Teknik RAEFISH menawarkan pandangan yang lebih besar dan lebih baik mengenai aktivitas RNA dalam jaringan kompleks
Untuk pertama kalinya, ilmuwan dapat melihat molekul RNA secara langsung di dalam sel dan jaringan dengan detail yang sangat kecil serta secara bersamaan di seluruh genom manusia, berkat teknologi baru yang dikembangkan oleh tim peneliti Yale.
Berlangganan ke kaminewsletteruntuk pembaruan berita teknologi terbaru.
Teknik yang dikenal sebagai Reverse-padlock Amplicon Encoding Fluorescence In Situ Hybridization (RAEFISH) menyelesaikan tradeoff yang telah lama harus dibuat oleh para peneliti: detail versus cakupan. Alat-alat sebelumnya memaksa peneliti untuk memilih antara melihat jumlah gen yang terbatas dengan detail tinggi atau melihat banyak gen tetapi dengan tingkat detail yang terbatas mengenai lokasi transkrip mereka (RNA) dan bagaimana mereka berinteraksi.
Kami mengembangkan teknik yang memenuhi kedua kebutuhan secara bersamaan,” kata Siyuan (Steven) Wang, seorang profesor madya ilmu genetika dan biologi sel di Yale School of Medicine. “Ini menyelesaikan keterbatasan utama dari teknologi sebelumnya dalam bidang transcriptomik spasial.
Teknologi baru tersebut dijelaskan dalam sebuah studiditerbitkandi jurnalSel.
Teknik transcriptomik spasial berbasis gambar secara langsung menggambar molekul RNA dalam sel dan jaringan untuk memetakan lokasi RNA dan pola ekspresi gen.
Teknik RAEFISH merupakan kemajuan yang kuat dalam proses pencitraan ini, kata para peneliti. Mereka menciptakannya dengan merancang penyelidik khusus yang melekat pada molekul RNA di dalam sel. Penyelidik tersebut membuat salinan RNA yang ditargetkan, dan tanda fluoresen ditambahkan sehingga RNA dapat dilihat di bawah mikroskop.
Metode ini telah diuji pada sel manusia dan jaringan dari hati tikus, plasenta, dan kelenjar getah bening, dapat mengidentifikasi molekul RNA berbeda dari lebih dari 20.000 gen. RAEFISH mampu memetakan jenis sel, menunjukkan bagaimana sel tersusun, dan mengungkap interaksi antara jenis sel yang berbeda melalui pola ekspresi gen mereka.
Ini akan membantu mengungkap tidak hanya gen-gen mana yang aktif, tetapi juga di bagian mana dalam sel atau jaringan mereka bekerja, kata para peneliti. Selain itu, pandangan yang diperluas ini juga mungkin memberikan wawasan baru tentang proses perkembangan dan penuaan pada jaringan kompleks, serta bagaimana banyak penyakit berkembang dan berkembang.
“Kami bisa potensial menemukan biomarker terapeutik baru untuk mengobati penyakit seperti kanker di mana sangat penting untuk memahami bagaimana sel kanker berinteraksi dengan sel-sel lain dalam lingkungan mikro jaringan sekitarnya,” kata Wang.
Pencapaian dalam teknologi imaging omics, seperti RAEFISH, sedang mendorong masa depan penelitian medis saat ini, memicu intervensi terapeutik baru, kata Wang.
Kita berada di era di mana alat-alat mulai tersedia untuk menghadapi tingkat kompleksitas yang lebih besar,” katanya. “Mampu sekarang mempelajari ekspresi gen dan interaksi sel dengan detail yang lebih besar dalam kompleksitas lingkungan jaringan asli, yang akan berguna dalam menyelidiki berbagai penyakit.
Informasi lebih lanjut:Yubao Cheng dkk, Sequencing-free whole-genome spatial transcriptomics pada resolusi molekul tunggal,Sel(2025).DOI: 10.1016/j.cell.2025.09.006
Disediakan oleh Universitas Yale
Cerita ini pertama kali diterbitkan diBisakimia.
- Mengapa Reptil Tidak Sering Berbicara? Ini Jawabannya - February 16, 2026
- Pemetaan ‘percakapan’ RNA-protein dapat mengungkap pengobatan baru untuk kanker dan penyakit otak - February 16, 2026
- The Secret Sky: Particle Accelerator Reveals Ancient Greek Star Map - February 16, 2026
Leave a Reply